《扫黑风暴》即将迎来大结局，两条主线林汉坠江案与麦自立案线索逐渐清晰，凶手高明远也浮出水面。但是这两条主线除了都与高明远有关之外，其实麦自立的死与林汉有着莫大的关系。正是因为林汉做了一个错误的决定，导致了他与麦自立双双惨死，而高明远借此发挥一箭三雕。
扫黑风暴中，林汉一直是活在李成阳记忆里，刚开始说林汉是醉酒开车掉河里死亡，车内还发现大量现金，说是贪污的证据，显然林汉的死没那么简单，随着剧情的深入，李成阳找到马帅留下的信，上面告诉李成阳林汉是被高明远害死的。
随着剧情接近尾声，之前的很多让人问题的真相，都慢慢浮出了水面！剧情一开始，李成阳就在调查他师父林汉遇害的事情，而随着贺芸的落网，林汉遇害的真相终于浮出了水面！
23集李成阳回到马帅的办公室，看到自己和马帅的照片，恍惚想起了当年马帅无意中救了自己的事。李成阳开始在马帅的办公室转悠，从他常用的望远镜中发现了一个房间。李成阳前去询问调查，发现望远镜中的房间是一个酒店的房间，马帅长年在这里包房，可却没来过几次，而且也不让人打扫，灯也是一直亮着的。
就是在这间布满灰尘的房间，李成阳发现了一个保险箱，让人把保险箱打开后，李成阳看到里面有两瓶酒，分别写着自己和马帅的名字，除了钱以外，还有一些资料和文件，以及一封写给李成阳的信。马帅在信中将董耀杀害麦自立的事情交代得一清二楚，十四年前，麦自立是质检员，因为马帅的工程有质量问题，麦自立不愿意签字。董耀在给麦自立喝的饮料中下药，在麦自立不愿意签字以后，董耀彻底对他下了杀心。麦自立喝饮料昏迷，董耀用锤子将毫无知觉的他杀死。
至于林汉，马帅说他是被高明远害死的。十四年了，李成阳终于弄清楚了师父的死，他的内心翻腾倒海，一幕幕回忆，回荡在脑海中。李成阳将信交给何勇，何勇看完信后，他也告诉李成阳一个重要的线索。十六年前的一起强奸杀人案罪犯高赫没有死，他整容后改了名，现在叫孙兴，而且他和高明远的关系不一般，孙兴有可能是高明远的儿子。何勇怀疑麦自立的死，林汉的死，以及李成阳被开除出警队，都和高赫的案子有直接的关系。李成阳忍不住哭了，他能扛到今天，就是因为师父林汉，他被开除出警队，忍辱负重了十四年，他现在终于发现了林汉死背后的一些线索。
麦自立尸体被挖出，董耀认罪。他对警方说明十四年前是他与麦自立在村村通上因为土地问题起了纷争，之后他在高明远的暗示下杀了麦自立然后藏尸。但是单凭麦自立一个人的供词来看，这个案件不够清晰，以高明远的性格和手段，他在绿藤只手遮天。
又何必跟一个质检员过不去，如果项目实施不了，他也会有别的办法，为什么他非要董耀杀死麦自立。也就是说高明远借董耀杀掉麦自立其实有别的原因，而这个疑点一直到贺芸自首才得以解开。她对警方阐述了十四年前的真相，原来这两个案件隐藏着不为人知的联系。
麦自立与林汉其实是大学同学，只不过之后林汉做了刑警，而麦自立成为了项目质检员。他们二人共同特点就是都十分有正义感。
十四年前，高赫因犯强奸杀人案被抓捕。而这个案件的受害者就是麦自立的妹妹，经手这个案件的人就是林汉。
依照法律判决，高赫应该被处以死刑。而贺芸与高明远为了保住高赫的性命，先后打点了许多人，让高赫改判为死缓，之后贺芸利用职务便利给高赫买了专利并申请保外就医。
本该处以死刑的高赫，就只坐了几年的牢，之后便逍遥法外。麦自立身为受害人的哥哥，自然是认识高赫的，一次外出他偶然在街边遇到了高赫，并且还目睹高赫上了高明远的车。
他顿时便坐不住了，强奸还杀害了自己妹妹的罪犯，非但没有得到法律的制裁，反而在大街上大摇大摆。于是他就找上了自己的老同学林汉，让他帮忙确认高赫是不是还在服刑中。
林汉听完便展开了调查，本来此事可是查清然后给高赫应有的惩罚。可惜林汉在这个时候却做了一个错误的决定，直接害了两条人命，而徒弟李成阳也因此被开除了警籍。林汉察觉到案件不合理的时候，便去找上了贺芸，她将所有的事情一五一十都告诉给了贺芸。
贺芸知道林汉已经发现了高赫，心中顿时十分慌张，但她还是故作镇静地问除了林汉之外还有没有别人知道这件事情。林汉直言道是受害人哥哥麦自立亲眼目睹，再没有别人知道此事。
而贺芸也放下心来，她将事情告诉了高明远，让高明远想想对策。于是高明远拿了三十万现金去找林汉，希望通过贿赂让他不要再插手此事。
但是林汉骨子里的的使命感和正义感不允许他这么做，他坚决地拒绝了高明远。高明远彻底被激怒，他直接打晕了林汉，并将三十万现金放在了林汉车的后备箱里，之后在他身上压了块大石头。
林汉就此坠江而亡，还在死后被盖上了黑警的帽子，声名狼藉。而同样知道实情的麦自立也被高明远借董耀的手杀死，李成阳作为林汉的徒弟，如果知道事情真相之后，一定会为师父申冤。
于是高明远一不做二不休，让贺芸在李成阳的储物柜放了与林汉被栽赃的三十万连号的二十万现金。并利用条例漏洞，让贺芸签了开除李成阳警籍的通知。两条人命就因为林汉的一个错误决定而陨落，而李成阳也蒙受了长达十四年的冤屈，高明远经此一事也是一件三雕。
第一，高明远栽赃陷害林汉，让高赫得以逃脱法律的制裁，并改头换面成为了孙兴 。
第二，高明远借董耀之手杀害了麦自立，既拿下了村村通项目，同时也除掉了高赫犯罪的最后一个证人。
第三，高明远让董耀杀害麦自立，马帅被迫牵扯其中，而马帅也就此被高明远掌控在了手中，成为了他在绿藤做的局中的一枚棋子。
正义也许会迟到，但永远不会缺席。即便高明远织的网再大，也终究会被推翻。何勇及中央督导组终于查明真相，受害者得以沉冤昭雪，而高明远也被判处了死刑。
